Hein Vermeulen bekleedt de leerstoel Belastingrecht aan de Faculteit der Rechtsgeleerdheid van de Universiteit van Amsterdam. Hij is de voorzitter van de leerstoelgroep belastingrecht. Hij verzorgt onderwijs in de volgende vakken:
Hein is (co-)redacteur en (co-)auteur van de boeken 'Hoofdzaken belastingrecht' (Boom 2019 en 2020), 'Grondslagen internationaal belastingrecht' (Boom, 2015, 2016 en 2019), 'European Tax Law' (Kluwer, 2018), ‘The Tax Treatment of CIVs and REITs’ (IBFD, 2013) en 'Het regime voor de fiscale beleggingsinstelling' (Kluwer, 2012).
Hij is tevens werkzaam bij de EU Direct Tax Group (EUDTG) van PwC.